Der Vorstand von SWISSCOFEL besteht aus insgesamt 16 Mitgliedern, davon 15 aus der Mitgliedschaft sowie ein Vertreter der Politik. Der Vorstand ist so zusammengestellt, dass er, wann immer möglich, den Verband punkto Tätigkeiten (Gross- und Detailhandel sowie Convenience) und Sprachregionen repräsentiert. Dabei sind immer die Präsidenten der Produktegruppen fix im Vorstand vertreten, damit auch die Vertretung der einzelnen Produktegruppen angemessen sichergestellt werden kann.
Als oberstes Organ in der Führung des Verbandes hat der Vorstand die Aufgabe sicherzustellen, dass SWISSCOFEL den statuarischen Auftrag möglichst effizient und effektiv im Sinne seiner Mitglieder erfüllt und sorgt dabei für eine klare Strategie und die Bereitstellung der entsprechenden Ressourcen.
Der Vorstand kontrolliert die operative Führung des Verbandes, welche primär in den Händen des Präsidialausschusses liegt, welcher aus dem Präsidenten, den Vize-Präsidenten sowie dem Direktor besteht.